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收件期間：自進入日期前5-60日開放申請，於進入日期前14日先抽籤再審查方式。
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人員名冊管理規定：每件申請人數以15人為限，每日、每件、每區人員姓名與身分證字號(含申請人)均不得重複填寫。
同一團體總人數超過15人者，須分件申請，各分件申請人姓名不得重複，但允許使用相同Email，以便利統一掌握各分件申請進度。
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生態承載量管制與抽籤機制：非因科學研究或其他特殊目的申請入園者，申請人數於進入日期前14日超過生態承載量時，系統將自動隨機抽籤，中籤者具正取送審資格。如果申請人數未超過生態承載量時，直接具正取送審資格，符合上述資格者系統發送通知，始得進入審查程序。抽籤結果請隨時查閱網站公布名單。
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審查期間：具正、備取資格者須通過審查方取得許可。經審查核准入園者，系統發給通知並顯示「正取核准」之狀態，於進入日期前4日起開放下載許可證；經審查申請不符入園規定者，則予以駁退。
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要求補件及補件再審期間：經審查認定資料填寫錯誤或不足者，系統將發給補件通知，申請人於收到通知當天起2日內須登入系統完成補件，僅給予1次補件機會。補件後再審查符合規定者，系統發給通知並顯示「正取核准」之狀態；逾時未補件或已補件但經審查仍不符規定者將逕予駁退，釋出名額提供候補人員遞補。
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第一次抽籤後到最後申請期間之遞補：已中籤案件若有人取消，或因審核資格不符遭駁退而釋出名額，系統將每日自動檢查是否有空額，有空額時將以既有未抽中案件加上新申請案（進入日期前5至14日申請者）一起抽籤遞補，抽中者系統發給通知並顯示「備取送審」之狀態。正、備取者之總人數以不超過生態承載量為原則。
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進入自然保護區域期間：請列印許可證後攜帶進入，並注意相關規定事項。
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申請取消、修改及註銷規定：第一次抽籤前之收件期間可登入系統自行取消申請及修改部分資料；審查期間至進入日期前1日，可登入系統自行註銷申請，但為顧及備取等待者候補之權益，如確實無法成行時請務必提早於6日前註銷，以利系統提供備取空額。
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依抽籤及審查結果，系統發送通知並顯示「抽籤未中」、「申請駁退」、「補件駁退」、「遞補失敗」之狀態，即喪失資格，可重新於其他日期提出申請。