針對媒體今(21)日報導行政院組改相關議題，人事總處表示，行政院組織調整自101年施行迄今，均係採「分批立法、分階段施行」原則進行，本次係因應新環境議題挑戰，務實調整部分規劃，將長達10餘年尚未組改的5部1會儘速完成立法，是負責任政府應有作為。又完成立法後，行政院僅有10個三級機關首長得以雙軌進用，且此制度歷經各政黨執政時期，均是為應部分機關業務特殊需要所為制度化設計，絕沒有媒體報導所謂為安插特定對象而量身訂做情事。
人事總處說明，101年原規劃整合氣水土林成立環境資源部，但涉及層面廣泛，各界對於整合方向一直缺乏共識，為積極回應全球環境變遷與資源循環等新興環境問題，因此本次從務實的角度規劃將環保署改制為環境部，至氣水土林業務因已有相關制度化協調運作機制，因此續留交通部、經濟部及農業部。至於報載所述環境部已統合環境資源，卻又把水土保持署、林業及自然保育署劃歸農業部顯然與事實不符。
至成立數位發展部及科技部改制國科會，則是因應國家數位轉型，經參酌各國相繼成立專責組織經驗，整合電信、資訊、資安、網路與傳播五大領域，於111年成立數位發展部；另為強化科技預算資源分配之統合、協調角色，將科技部改制為國科會，主委並由政務委員兼任。而不論是環保署改制為環境部、農委會改制為農業部，或是科技部改制為國科會，改制前後均同為行政院所屬部會層級機關，且首長均為特任，沒有所謂升格或降級情形。
人事總處另外指出，針對三級機關首長雙軌制，中央行政機關組織基準法於 93 年立法制定時，第 18 條已明訂三級機關首長除性質特殊且法律有規定得列政務職務外，其餘應為常務職務。該條文歷經99年修法，乃至101年組改啟動，均沒有改變，且三級機關首長的任用方式，仍須訂於各該機關組織法律中，最終是由立法院做出最後的立法決定。
又目前立法通過之7個雙軌任用三級機關中，除102年第1個採雙軌任用的中央健康保險署，以及111年施行之數位部資通安全署外，其餘包括102年內政部空中勤務總隊、104年通過的海委會海洋保育署、105年環保署毒物及化學物質局、110年國防部全民防衛動員署及111年數位部數位產業署等，均為立法院審議時立法委員考量機關高度專業領域，並賦予取才彈性，主動提案獲致共識後將首長任用方式增加得以政務常務雙軌進用，顯示制度設計並無黨派之特殊考量，純粹為業務推動所需。
人事總處最後強調，本篇報導未經查證瞭解整個行政院組改原委及政府實際運作，諸多內容未根據事實，請勿再以訛傳訛刻意曲解行政院推動組改之相關規劃與作為。聯絡人：組編人力處 賀科長怡嘉電話：02-23979298轉360。